Программа реорганизации Комитета состоит из трех этапов.

Целями первого этапа реорганизации являются повышение эффективности и прозрачности деятельности Комитета, а также обеспечение доступа населения к продуктам (программы развития: малого и среднего бизнеса, промышленности (в т.ч. АПК и ОПК), развития потребительского рынка; концепция и программа СЭР; стандарты проживания; формирование АИП, предоставление финансирования предприятиям, предоставление услуг бизнес-инкубирования, продвижение продукции предприятий города, инженерная подготовка промышленных территорий, содействие реализации проектов, и т.д.) и услугам Комитета (оформление, выдача лицензий, выдача разрешительных писем о проведении региональной лотереи и т.д.).

Второй этап включает в себя меры по переходу Комитета на принципы проектно-ориентированной организации, внедрение ключевых показателей эффективности персонала и системы постоянного планирования, контроля и оценки деятельности.

Третий этап преобразований Комитета содержит комплекс мер по реорганизации подведомственных учреждений.

В ходе первого этапа реорганизации Комитета оценивалась действующая организационная структура, навыки персонала, стиль управления руководящего состава, а также система управления текущей деятельностью Комитета. В результате проведенного анализа удалось исключить дублирующие функции в различных подразделениях, объединить технологически связанные функции в общие блоки, а также определить уровень подготовки персонала.

В новой организационной структуре предусмотрено создание четырех блоков, таким образом, сокращению подлежат 3 должности заместителей председателя Комитета с 7 до 4 человек.

К задачам первого блока относятся: стратегическое планирование социально-экономического развития города, постоянный мониторинг текущей ситуации в экономике, обеспечение эффективного использования бюджетных средств (за счет управления адресной инвестиционной программой, бюджетным нормированием и ценообразованием). Оставшиеся заместители председателя Комитета возглавят три отраслевых блока: промышленности и развития промышленных территорий, потребительского рынка и лицензирования, поддержки малого и среднего и инновационного предпринимательства.

Сокращение общей численности штатных единиц относительно прежней структуры составляет 18,3% (50 человек). В процессе оптимизации было освобождено здание на Садовой д.14 и вдвое сокращено использование служебного автотранспорта. Таким образом, общие затраты на содержание Комитета сократились на 15%.

При этом в Комитете добавляются три новых направления деятельности: мониторинг стандартов проживания, внешнеэкономическая деятельность и маркетинг.

1. В целях обеспечения устойчивого социально-экономического развития города Правительством утверждены стандарты проживания в Санкт-Петербурге, которые содержат конкретные и измеримые показатели качества жизни горожан, за достижение которых отвечает городское правительство. Кроме того, Правительством Санкт-Петербурга определены профильные комитеты, отвечающие за достижение утвержденных значений стандартов проживания. Отдел мониторинга стандартов проживания будет осуществлять постоянное наблюдение, анализ, сбор информации о достижении Правительством утвержденных значений стандартов проживания населения. Результаты мониторинга станут основой для оценки эффективности деятельности отраслевых комитетов и принятия решения о корректировке применяемых программ и мер государственной поддержки.
2. Санкт-Петербург является одним из крупнейших выставочных центров России и площадкой для проведения мероприятий международного уровня (Международный экономический форум, Международный инновационный форум и др.). Выставки, форумы, конгрессы, ярмарки оказывают значительное влияние на социально-экономическую жизнь города, выступая важнейшим средством для установления и развития связей петербургских предприятий и организаций с хозяйствующими субъектами регионов России и зарубежных государств. А также, для продвижения продукции петербургских производителей на российские и зарубежные рынки. При этом Санкт-Петербург - один из немногих регионов, где поддержка выставочно-ярмарочной деятельности имеет нормативную базу, которая постоянно совершенствуется. Понимая важность данного направления в комитете было создано отдельное подразделение внешнеэкономической и конгрессно-выставочной деятельности.
3. Отдел маркетинга создан в целях продвижения продуктов, услуг Комитета, а также повышения прозрачности работы ведомства. Также одной из задач подразделения станет оценка востребованности продуктов и услуг комитета со стороны конечных пользователей (население, предприятия, инвесторы и др.) и выработка предложений по их улучшению или выводу новых на рынок.